La organización de la Dirección Regional de Agricultura Cajamarca (DRAC) se basa en la Ley Orgánica de Gobiernos Regionales Nº 27867, el Decreto Ley Nº 25902 “Ley Orgánica del Ministerio de Agricultura”, y el Decreto Supremo Nº 017-2001-AG, que aprueba el Reglamento de Organización y Funciones del MINAG. Además, se rige por la Resolución Ejecutiva Regional Nº 321-2005-GR-CAJ/P, que aprueba el Reglamento y Organización de Funciones de la Dirección de Agricultura.
La DRAC está conformada por: la Dirección Regional, órganos de apoyo, órganos de asesoramiento, órganos de línea, y como órganos desconcentrados las 13 Agencias Agrarias (Cajamarca, Chota, Cutervo, Jaén, San Ignacio, Cajabamba, Celendín, San Marcos, Contumazá, San Pablo, San Miguel, Santa Cruz y Hualgayoc) y 2 Oficinas Agrarias.
